Persona 3 mendapat ulasan yang, kebanyakan daripadanya, adalah positif sejak keluarannya di Amerika Utara, dengan beberapa pujian di atas ceritanya yang unik, latar belakang dan pendampingan elemen gaya permainan sim sosial bersertakan pertarungan-pertarungan yang mendampingnya.[14] Kritikan seringkali merujuk kepada struktur permainannya yang berulang dan kepayahan meneroka tingkat-tingkat di dalam Tartarus yang dijana secara rawak. Beberapa komen lain yang serupa ditujukan terhadap muziknya yang dimainkan secara berulangan, serta kekurangan pengawalan parti. Sesetengah juga mengatakan bahawa struktur "hari demi hari" Persona 3, yang memberikan para pemain kebebasan untuk melakukan apa sahaja yang mereka ingini di antara waktu pertarungan yang boleh dan tidak boleh dielakkan, mungkin sekali mengakibatkan mereka berada di dalam situasi di mana mereka di bawah tahap yang sesuai untuk menghadapi serangan bos.[perlu rujukan]

Persona 3 juga telah terakru dengan sebuah kontroversi kecil,[15] kerana watak-wataknya menyeru "persona" mereka dengan menembak diri mereka di kepala dengan sejenis alatan yang digelar "Evoker," yang kelihatan serupa dengan sepucuk pistol. Namun begitu, Evoker tidak menggantikan penggunaan pistol di dalam dunia Persona 3, kerana pistol sebenar adalah digunakan oleh beberapa watak di dalam kisahnya.

GameSpot mengiktiraf Persona 3 sebagai judul RPG terbaik tahun 2007.[16]